故障1：液相色谱仪流动相内有气泡，关闭泵，打开泄压阀，打开purge键，清洗脱气，气泡不断从过滤器冒出，进入流动相，无论打开purge键多少次，都无法清除不断产生的气泡。
原因：液相色谱仪的过滤器长期沉浸于乙酸铵等缓冲液内，过滤器内部由于霉菌的生长生长繁殖，形成菌团，阻塞了过滤器，缓冲液难以流畅地通过过滤器，空气在泵的压力作用下经过滤器进入流动相。
处理方法：处理过滤器浸泡于5%的硝酸溶液中，超声清洗几分钟即可，亦可将过滤器浸泡于5%硝酸溶液中12-36小时，轻轻震荡几次，再将过滤器用纯水清理几次，打开泄压阀，打开purge键，清洗脱气，如仍有气泡不断从过滤器冒出，说明过滤器中的霉菌菌团已被硝酸破坏，流动相可以流畅的通过过滤器。打开泄压阀，打开泵，流速调制1.0~3.0ml/min,纯水冲洗过滤器1小时左右，即可将过滤器冲洗干净。关闭泄压阀，纯甲醇冲洗半小时即可。
故障2：液相色谱仪柱压高，缓冲液盐分（如乙酸铵等）沉积柱内，样品污染沉积。
处理方法：缓冲盐分沉积柱内先用40~50℃的纯水，低速正向冲洗柱子，待柱压逐渐下降后，相应提高流速冲洗，柱压大幅度下降后，用常温纯水冲洗，之后用纯甲醇冲洗柱子30分钟。样品污染沉积，有样品沉积引起污染的c18柱，和纯水反向冲洗柱子，然后换成甲醇冲洗，接着用甲醇+异丙醇冲洗柱子，再换成甲醇冲洗，然后用纯水冲洗，最后用甲醇冲洗正向冲洗柱子30分钟。
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