污水主要工艺过程设计如下：医院医疗废水由排污管道汇总经经过一道格栅，去除水中较大的悬浮、漂浮物和带状物，上清液重力自流进入调节池，调节池调节污水的水量和水质。调节池出水提升进入a级生化池（缺氧池）和o级生化池（好氧池）进行生化处理。本工程污水中有机成份较高，bod5/codcr≈0.5，可生化性很好，因此采用生物处理方法大幅度降低污水中有机物含量是经济的。
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医院排出的放射性废水常用贮存衰减法处理。医院常用的放射性同位素如131碘,32磷,198金，24钠等是半衰期较短的同位素，因此可以将放射性污水贮存于地下专用衰变水池内,贮存时间为10倍于半衰期,把放射性浓度降到容许排放的程度。如果放射性污水的浓度很低，水量很小，也可用稀释法处理。中国的《放射性防护规定》要求每一微居里放射性同位素达到容许排放浓度需稀释水量1.67米3。当放射性污水浓度很高,放射性的半衰期很长，不宜用贮存法和稀释法处理时，可用蒸发法、离子交换法或凝聚沉淀法进行分离浓缩处理。
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医院污水主要来自妇幼保健、常规诊断的医务工作人员及病人的正常生活用水，医疗用具消毒、清洁用水以及医护人员生活区的生活污水，其水质除与普通生活污水相似外，还含有大量病原性微生物，如病菌、病毒、原虫等，以及重金属（化验室、放射科等污水），如酚、洗衣房的直链苯磺酸盐（las）等有毒、有害的有机和无机化合物。放射性废水（放射性诊断过程排出的含有放射性同位素的废水）是致畸、致突变物质、codcr、bod5、nh3-n、ss等，对环境危害大，若不加以处理，这些物质排入水体将对环境造成巨大的危害并长期危害人体健康，甚至引起传染病的爆发流行。
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